SALAD主要機能一覧
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モチーフアライメント
特定のモチーフで整列させて構造を比較することができる
モチーフでNJ樹
モチーフをクリックするだけで、モチーフ配列で作った進化系統樹(NJ法)が簡単に見れる
配列ロゴ作成
系統樹のノード(樹形の分岐部分)をクリックするだけで、そのノードに含まれる配列で配列ロゴが作成できる
グラフィカルビュアー
同じドメインを持つグループや、配列の類似性でまとめられたグループのモチーフ構造がグラフィカルに見れる
ブラウザ上でモチーフ構造の表示データが操作できる(拡大・縮小・視点移動)
遺伝子情報表示
既知の遺伝子の情報を利用することもできる
Pfamドメインの情報表示
Pfamドメインとの関係をグラフィカルに表示することが可能
他のデータベースへのリンク
各アノテーションには他のデータベース(NCBI等)へのリンクがある
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