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イネ、シロイヌナズナ、シゾン(SALADの現バージョンのデータセット)以外の配列を使われる方は、是非この機能を使って解析をして下さい。

全てのデータは相同性のあるグループごとに保存モチーフの抽出・解析をしておりますので、グループセットによって抽出されるモチーフセットが異なることがあります。同じアノテーションに関して、複数の解析結果を参照することで、思わぬ発見にもつながります。また、インタラクティブ機能を使って、ユーザーの作成したグループからのモチーフ抽出・解析も可能です。こちらもお試しください。


SALAD解析を実行するには入力欄に記入し、「Upload」ボタンを押して下さい。
Job title: 

You can use alphameric characters[a-zA-Z0-9], "_", "-"

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Upload file: 

Options
The type of sequence model to use
Distribution of motifs One per sequence
Zero or one per sequnece
Any number of repetitions

Motif width
minimum motif width (>=2)
maximum motif width (<=300)

Number of motifs to find
maximum number of motifs to find
Expect threshold (E-value)

Number of sites for each motif
Minimum sites (>=2)
Maximum sites (<=300)



※ファイルの注意 :
・アップロードするファイルはFasta形式で用意して下さい
・現在のバージョンではファイルの上限は配列数120、
もしくは、ファイルサイズで1MBです
・ファイルには2配列以上含まれている必要があります





フローチャート