BLASTによる検索
アノテーション情報からの検索
ドメイン情報からの検索 (ver. 1.0のみ)
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SALAD BLAST
Program:
blastn (DNA query vs DNA database)
blastp (Amino Acid query vs Amino Acid database)
blastx (DNA query vs Amino Acid database)
tblastn (Amino Acid query vs DNA database)
tblastx (DNA query vs DNA database)
Query:
Database:
version 3.0 (Protein Sequence)
version 2.0 (Protein Sequence)
version 1.0 (Protein Sequence)
Species:
Help page
詳細オプション
Maximum number :
10
50
100
250
500
1000
2000
アライメントを表示する配列の最大数を指定します
Expect threshold :
10
1
0.1
0.01
1e-10
1e-20
1e-50
E値の閾値を指定します
Filter :
On
Off
Onにすることで複雑度が低い領域を無視することができます
Word size :
ワードサイズを指定します
デフォルトは11(blastn), 3(他のプログラム)が使われています
Mask :
小文字を無視します